Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Rb1cc1Q9ESK9 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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