Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp29Q9ES63 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp29Q9ES63 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms