Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnft1Q9DCN7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms