Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Smg9Q9DB90 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smg9Q9DB90 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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