Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ap1s2Q9DB50 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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