Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Subh2bvQ9D9Z7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Subh2bvQ9D9Z7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Subh2bvQ9D9Z7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Subh2bvQ9D9Z7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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