Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms