Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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