Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms