Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Snx29Q9D3S3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snx29Q9D3S3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms