Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Trappc6bQ9D289 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Trappc6bQ9D289 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc6bQ9D289 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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