Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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