Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Spc24Q9D083 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms