Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mms19Q9D071 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mms19Q9D071 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms