Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc47Q9D024 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms