Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms