Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms