Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sgo1Q9CXH7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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