Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pin4Q9CWW6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pin4Q9CWW6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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