Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms