Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfdn1Q9CWM4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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