Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms