Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg3Q9CPX6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms