Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrrtQ99MR6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms