Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms