Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp16Q99LG0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms