Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms