Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TrabdQ99JY4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrabdQ99JY4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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