Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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