Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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