Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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