Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc115Q8VE99 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms