Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc6a20aQ8VDB9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Slc6a20aQ8VDB9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Slc6a20aQ8VDB9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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