Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I8

Defb19, Beta-defensin 19, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb19Q8K3I8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defb19Q8K3I8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms