Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ssh3Q8K330 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms