Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbm48Q8K2X2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms