Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Abcf3Q8K268 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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