Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Scnm1Q8K136 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Scnm1Q8K136 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms