Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrit1Q8K099 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrit1Q8K099 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms