Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Znf628Q8CJ78 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Znf628Q8CJ78 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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