Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LgsnQ8CIX8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms