Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hpf1Q8CFE2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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