Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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