Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms