Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PgghgQ8BP56 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms