Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nop53Q8BK35 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop53Q8BK35 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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