Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smarcal1Q8BJL0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smarcal1Q8BJL0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Smarcal1Q8BJL0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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