Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NischQ80TM9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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