Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nek5Q7TSC3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nek5Q7TSC3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms