Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rnf139Q7TMV1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf139Q7TMV1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf139Q7TMV1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf139Q7TMV1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rnf139Q7TMV1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rnf139Q7TMV1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf139Q7TMV1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf139Q7TMV1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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